posiadającą specjalistyczny księgozbiór naukowy. Obejmuje on literaturę związaną tematycznie z profilem zbiorów muzealnych. Są to wydawnictwa z następujących dziedzin: historii, sztuki, etnografii, archeologii, muzealnictwa i ochrony zabytków. Szczególną zaś wagę przykłada się do wydawnictw dotyczących Pomorza i Chojnic, treściowo związanych z Chojnicami lub tutaj wydanych. Zbiory pomorzoznawcze stanowią około 1/3 zasobów. W zasobach bibliotecznych znajdują się unikatowe pozycje lokalnej, przedwojennej prasy, jak Conitzer Mitteilungen, Konitzer Tageblatt, Dziennik Pomorski, Lud Pomorski. W księgozbiorze wyróżnić można następujące grupy tematyczne:
Do najcenniejszych i najciekawszych należąstarodruki w liczbie 35 pozycji, wśród nich m.in.: Listy papieża Leona X zebrane przez Piotra Bembi z 1552 r., Ewangelie i Lekcje z roku 1556, Prawodawstwo kościelne Pomorza z 1690 r., Opis budowli sakralnych Gdańskaz 1695 r. Bartela Ranischa ilustrowany sztychami, Historia Prus Książęcych (1526-1733) wydana przez patrycjusza gdańskiego Gottfrieda Lengnicha w Gdańsku w l. 1722-1756w 9 tomach.
Biblioteka spełnia trzy główne zadania – gromadzi zbiory, opracowuje i udostępnia w czytelni. Niezastrzeżoną część księgozbioru wypożycza na zewnątrz tylko pracownikom muzeum. Prowadzi też wypożyczalnię międzybiblioteczną. Uzupełnianie księgozbioru odbywa się poprzez ciągłą penetrację oferty wydawniczej, zakupy w księgarniach specjalistycznych, darowizny od osób prywatnych oraz wymianę wydawnictwz muzeami i instytucjami naukowymi w kraju.